Umowa między BGK i MON precyzuje procedury i mechanizmy współpracy między instytucjami. Mają być gotowe przed 1 lipca tego roku kiedy Fundusz Wsparcia SZ zacznie działać.
Umowa określa zasady m.in. dokonywania wypłat ze środków Funduszu; opracowania i aktualizacji planu finansowego i prognozy przychodów oraz wydatków Funduszu; udzielania finansowania oraz zakresu i terminów sporządzania sprawozdania z realizacji planu finansowego FWSZ. Choć na razie niewiele wiadomo o przyszłych zasobach zbrojeniowego funduszu, to ustawa o obronie Ojczyzny określa źródła zasilania FWSZ. To przede wszystkim wpływy ze skarbowych papierów wartościowych i wpłaty z emisji obligacji BGK. FWSZ będzie też zasilany odpisami z zysku Narodowego Banku Polskiego. Jednak NBP jako niezależna instytucja miałby sam określać wielkość zysku możliwego do przekazania funduszowi.